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閱讀次數(shù):1604 發(fā)布時間:2011/12/28 11:05:22
利用基因組測序和RNA測序,研究小組特征化地描述了之前未知的基因融合事件,研究的案例是, 33歲大的韓國男性患有肺癌卻沒有吸煙史和家族遺傳史。參與研究的科學(xué)家分別來自Macrogen公司、醫(yī)用基因組研究所-首爾國立大學(xué)、首爾圣母醫(yī)院、 首爾國立大學(xué)醫(yī)學(xué)院和Psoma Therapeutics公司。
Jeong-Sun Seo 博士是醫(yī)用基因組研究所-首爾國立大學(xué)的負責(zé)人、Macrogen公司的主席以及該研究的資深作者,他說:“基因組測序技術(shù)能夠解釋之前隱藏的人類癌癥的病因,個性化的癌癥治療可依此作為醫(yī)用靶點。”
測序后,研究小組比較了病人血液中癌細胞和正常細胞的基因組,在已知的癌癥相關(guān)基因(如,EGFR、KRAS和EML4-ALK)中沒有發(fā)現(xiàn)突變, 通常這些基因的突變可解釋這一病例。進一步研究發(fā)現(xiàn),癌細胞中提取的RNA測序后能揭示基因重排事件,這一現(xiàn)象很可能是腫瘤發(fā)生的誘導(dǎo)因子,而在基因組測 序時很難被發(fā)現(xiàn)。
從RNA序列分析中,研究人員建立了一系列的候補基因融合事件,并把誘癌因子歸結(jié)為單一事件,即KIF5B 和RET融合,10號染色體上出現(xiàn)該基因的反轉(zhuǎn)。這一融合事件之所以令人感興趣,是因為之前的研究提到了RET基因與其它基因的融合是甲狀腺癌癥的誘因, 盡管它在肺中表達水平低,但是在病人身上高表達。此外,KIF5B的蛋白結(jié)構(gòu)域在啟動基因融合事件中不可或缺。
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